巴氏杀菌机、巴氏灭菌机、低温巴氏设备主要应用于食品饮料等行业，名子有很多，可以延伸为低温杀菌机、低温杀菌设备、巴氏杀菌设备。最早是用于啤酒的杀菌领域，起源于法国酿酒业，巴斯德受人之托，为了解决啤酒的发酸的情况，当时啤酒酿出后无法饮用。最后，巴斯德的研究结果是：以50~60摄氏度的温度加热啤酒半小时，就可以杀死啤酒里的乳酸杆菌和芽孢，而不必煮沸。这一方法挽救了法国的酿酒业。这种灭菌法也就被称为“巴氏灭菌法”。

现在在巴氏杀菌机主要用于奶制品和一些豆干类、腌渍菜类、米酒等产品的杀菌，根本的宗旨没有改变，利用水温杀死包装内的有害菌类，使其不会在包装好的产品内进行繁衍，进而达到灭菌的目的，温度在高低因产品的类别而不一，巴氏杀菌的水温并不是越高越好，有些产品如果用高温的方法反而会造成口感和品质的变化。

软包装（袋装）的产品一般会采用水浴式网带巴氏杀菌机，只要产品可以杀透，产品可以采用堆叠的方式进行处理，不论是哪种产品，必须要杀透，否则杀菌就没有意义。